ANÁLISE IN SILICO DA VARIABILIDADE GENÉTICA DO ONCOGENE E5 DO HPV 16

Abstract

Introdução: O Papilomavírus humano (HPV) é o responsável por causar diversos tipos de cânceres, destacando-se o cervical, e as lesões genitais, sendo o oncogene E5 pertencente a esse patógeno importante para seu potencial oncogênico. Objetivo: Analisar a variabilidade genética in silico do gene E5 das sequências gênicas do HPV 16. Método: Trata-se de um estudo descritivo, quanti-qualitativo, ao apresentar o mapeamento e quantificar as regiões polimórficas do gene E5. Para a coleta das sequencias gênicas, foi utilizado o banco de dados genômicos do National Center for Biotechnology Information (NCBI). As sequências gênicas foram coletadas no formato FASTA. Posteriormente, foi utilizado o programa CLUSTALW, do pacote de dados do software MEGA6, para a realização do alinhamento múltiplo das sequências, permitindo a identificação de sítios polimórficos entre duas ou mais sequências gênicas. Resultados: As análises das variações do oncogene E5 do HPV16 revelaram a existência de vários sítios polimórficos, bem como as variações encontradas nas sequencias das variantes, em relação à sequência protótipo K02718. Em relação ao mapeamento dos epítopos foi observado que a sequência da oncoproteína 16E5 da amostra de referência K02718, formou epítopos imunogênicos com moléculas pertencentes ao MHC-I (HLA-A e HLA-B) e MHC-II (HLADR), sendo as moléculas complexo HLA-A estão mais relacionadas com a ação da oncorproteína 16E5. Conclusões: O estudo dos epítopos imunogênicos é útil para o planejamento da identificação de progressões carcinogênicas precoces, sendo a biologia computacional uma nova vertente de estudo científico para identificação e ação inicial para o desenvolvimento de estratégias imunoterapêuticas.